Zirkadiane Uhren und Stoffwechsel

Projekt Team

“Fatih Aygenli” (fatih.aygenli@med.uni-muenchen.de)

“Lukas Huschet” Lukas.Huschet@med.uni-muenchen.de

Finanzierung: Chromatin Dynamics SFB1064

Zirkadiane Uhren und Stoffwechsel

Zirkadiane Uhren sind zellendogene, selbst­erhaltende Oszillatoren, die in nahezu jeder Zelle des Körpers vorkommen und eine grundlegende Rolle für die zelluläre und gewebespezifische Physiologie spielen. Dieses interne Zeitmesssystem ermöglicht es unseren Organen, ihren Stoffwechsel auf molekularer Ebene vorausschauend an täglich wiederkehrende Anforderungen anzupassen, die mit Veränderungen der Umwelt einhergehen. Während die zirkadiane Uhr den Stoffwechsel reguliert, wirken umgekehrt metabolische Zustände auf die zirkadiane Uhr zurück und modulieren deren Funktion. Wir untersuchen diesen molekularen Crosstalk in peripheren metabolischen Geweben der Maus unter Einsatz von Interaktions- und räumlicher Proteomik sowie Phosphoproteomik.

Ein Teil dieser Arbeiten wird von der DFG im Rahmen des Sonderforschungsbereichs CRC1064 Chromatin Dynamics and Foundations of Circadian Medicine TRR418 gefördert
(https://www.circadianmedicine.de).

Schmal C, Maier B, Ashwal-Fluss R, Bartok O, Finger AM, Bange T, Koutsouli S, Robles MS, Kadener S, Herzel H, Kramer A. (2023) Alternative polyadenylation factor CPSF6 regulates temperature compensation of the mammalian circadian clock. PLoS Biol. Jun 28;21(6):e3002164. doi: 10.1371/journal.pbio.3002164.

Hamzeiy H, Ferretti D, Robles MS*, and Cox J*. (2022) Perseus plugin ‘Metis’ for metabolic pathway-centered quantitative multi-omics data analysis supporting static and time-series experimental designs. Cell Reports Methods. doi.org/10.1016/j.crmeth.2022.100198. *co- corresponding author.

Hansen FM, Tanzer MC, Brüning F, Bludau I, Stafford C, Schulman BA, Robles MS*, Karayel O*, Mann M*. (2021) Data-independent acquisition method for ubiquitinome analysis reveals regulation of circadian biology. Nat Commun. doi: 10.1038/s41467-020- 20509-1.*co-corresponding author

Brüning F, Humphrey SJ, Robles MS (2020) Phosphoproteome and Proteome Sample Preparation from Mouse Tissues for Circadian Analysis. Methods Mol Biol. doi: 10.1007/978-1-0716-0381-9_14.

Huschet LA, Kliem FP, Wienand P, Wunderlich CM, Ribeiro A, Bustos-Martínez I, Barco Á, Wunderlich FT, Lech M, Robles MS. (2024) FrozONE: schnelle Zellkernanreicherung für eine umfassende Proteomanalyse von gefrorenen Geweben. Life Sci Alliance. Dec 12;8(3):e202403130. doi: 10.26508/lsa.202403130.